Het specialisme Medische Microbiologie en Immunologie (MMI) onderzoekt patiëntenmateriaal ten behoeve van preventie, diagnostiek en therapie van infectieziekten en ziekten aan het immuunsysteem. De Medische Microbiologie, Medische Immunologie en Moleculaire Biologie van het St. Antonius Ziekenhuis zijn samen één afdeling. Naast het onderzoeken van patiëntenmateriaal, valt de afdeling Infectiepreventie ook onder de verantwoordelijkheid van het specialisme Medische Microbiologie en Immunologie (MMI). Ook verricht de MMI wetenschappelijk onderzoek, vaak in samenwerking met andere disciplines, zoals Hematologie en Longziekten. Daarnaast neemt de afdeling deel aan een samenwerkingsproject in Dhaka (Bangladesh) op het gebied van pneumonieën en het ICDDRB. Onderzoek wordt uitgevoerd in het kader van patiëntenzorg, de opleiding en Research & Development. De lopende onderzoeksprojecten zijn gecentreerd rond het thema 'gastheerfactoren/immuniteit en infecties'. Tot slot werkt onze afdeling MMI samen met het Diakonessenhuis Utrecht, Zeist en Doorn en het Zuwe Hofpoort Ziekenhuis Woerden. Gezamenlijk vormen de laboratoria van de ziekenhuizen het Streeklaboratorium voor de Volksgezondheid van de regio Utrecht. Het Streeklaboratorium heeft een functie voor de Openbare Gezondheidszorg.